MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Acidithiobacillus ferrivorans SS3 chromosome

Total Repeats: 58001

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1001	NC_015942	GC	3	6	48262	48267	0 %	0 %	50 %	50 %	344198278
1002	NC_015942	ACC	2	6	48292	48297	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	344198278
1003	NC_015942	GCC	2	6	48298	48303	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344198278
1004	NC_015942	GGC	2	6	48312	48317	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344198278
1005	NC_015942	ATCC	2	8	48321	48328	25 %	25 %	0 %	50 %	344198278
1006	NC_015942	TCG	2	6	48340	48345	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344198278
1007	NC_015942	GCG	2	6	48346	48351	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344198278
1008	NC_015942	GGC	2	6	48360	48365	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344198278
1009	NC_015942	CTGAAG	2	12	48391	48402	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	344198278
1010	NC_015942	CAG	2	6	48420	48425	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344198278
1011	NC_015942	GCC	2	6	48472	48477	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344198278
1012	NC_015942	CCA	2	6	48596	48601	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	344198278
1013	NC_015942	CAG	2	6	48624	48629	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344198278
1014	NC_015942	CCG	2	6	48635	48640	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344198278
1015	NC_015942	CAG	2	6	48672	48677	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344198278
1016	NC_015942	GAT	2	6	48689	48694	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	344198278
1017	NC_015942	CAG	2	6	48756	48761	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344198278
1018	NC_015942	CGG	2	6	48782	48787	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344198278
1019	NC_015942	CCG	2	6	48814	48819	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344198278
1020	NC_015942	CAG	2	6	48828	48833	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344198278
1021	NC_015942	AGC	2	6	48841	48846	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344198278
1022	NC_015942	GGC	2	6	48854	48859	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344198278
1023	NC_015942	CGC	2	6	48893	48898	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344198278
1024	NC_015942	ATGG	2	8	48909	48916	25 %	25 %	50 %	0 %	344198278
1025	NC_015942	GCTCCG	2	12	49075	49086	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	344198279
1026	NC_015942	CGC	2	6	49094	49099	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344198279
1027	NC_015942	CCG	2	6	49100	49105	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344198279
1028	NC_015942	GCT	2	6	49147	49152	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344198279
1029	NC_015942	CGG	2	6	49270	49275	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344198279
1030	NC_015942	CAG	2	6	49298	49303	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344198279
1031	NC_015942	CCG	3	9	49384	49392	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344198279
1032	NC_015942	GGGC	2	8	49423	49430	0 %	0 %	75 %	25 %	344198279
1033	NC_015942	CCG	2	6	49446	49451	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344198279
1034	NC_015942	CTG	2	6	49463	49468	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344198279
1035	NC_015942	AGG	2	6	49473	49478	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	344198279
1036	NC_015942	CAA	2	6	49610	49615	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	344198279
1037	NC_015942	GCCT	2	8	49625	49632	0 %	25 %	25 %	50 %	344198279
1038	NC_015942	CAG	2	6	49676	49681	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344198279
1039	NC_015942	TGT	2	6	49782	49787	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	344198279
1040	NC_015942	CAG	2	6	49792	49797	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344198279
1041	NC_015942	ACG	2	6	49967	49972	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344198280
1042	NC_015942	CAT	2	6	49997	50002	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	344198280
1043	NC_015942	AT	3	6	50043	50048	50 %	50 %	0 %	0 %	344198280
1044	NC_015942	CGCC	2	8	50086	50093	0 %	0 %	25 %	75 %	344198280
1045	NC_015942	ATC	2	6	50110	50115	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	344198280
1046	NC_015942	TTC	2	6	50122	50127	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	344198280
1047	NC_015942	TAG	2	6	50179	50184	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	344198280
1048	NC_015942	GCCGG	2	10	50209	50218	0 %	0 %	60 %	40 %	344198280
1049	NC_015942	C	6	6	50332	50337	0 %	0 %	0 %	100 %	344198280
1050	NC_015942	TGG	2	6	50429	50434	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	344198280
1051	NC_015942	ATC	2	6	50446	50451	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	344198280
1052	NC_015942	GCGG	2	8	50497	50504	0 %	0 %	75 %	25 %	344198280
1053	NC_015942	ATA	2	6	50552	50557	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	344198280
1054	NC_015942	TCCCA	2	10	50621	50630	20 %	20 %	0 %	60 %	344198280
1055	NC_015942	ACG	2	6	50632	50637	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344198280
1056	NC_015942	CCG	2	6	50659	50664	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344198280
1057	NC_015942	TGA	2	6	50732	50737	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	344198280
1058	NC_015942	CAG	2	6	50780	50785	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344198280
1059	NC_015942	AGC	2	6	50800	50805	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344198280
1060	NC_015942	ACC	2	6	50950	50955	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	344198280
1061	NC_015942	CCGT	2	8	51011	51018	0 %	25 %	25 %	50 %	344198280
1062	NC_015942	ACA	2	6	51073	51078	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	344198280
1063	NC_015942	GC	3	6	51230	51235	0 %	0 %	50 %	50 %	344198280
1064	NC_015942	GGC	2	6	51237	51242	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344198280
1065	NC_015942	GGC	2	6	51252	51257	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344198280
1066	NC_015942	TTG	2	6	51376	51381	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	344198280
1067	NC_015942	ACC	2	6	51837	51842	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	344198281
1068	NC_015942	CGA	2	6	51881	51886	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344198281
1069	NC_015942	CGT	2	6	51926	51931	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344198281
1070	NC_015942	CTCG	2	8	51938	51945	0 %	25 %	25 %	50 %	344198281
1071	NC_015942	GGA	2	6	51962	51967	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	344198281
1072	NC_015942	CGCCAA	2	12	51992	52003	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	344198281
1073	NC_015942	TCT	2	6	52077	52082	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	344198282
1074	NC_015942	TAC	2	6	52243	52248	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	344198282
1075	NC_015942	TGA	2	6	52290	52295	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	344198282
1076	NC_015942	ACT	2	6	52314	52319	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	344198282
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1078	NC_015942	TGCGCG	2	12	52841	52852	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	344198283
1079	NC_015942	GC	3	6	52890	52895	0 %	0 %	50 %	50 %	344198283
1080	NC_015942	CTGG	2	8	53063	53070	0 %	25 %	50 %	25 %	344198284
1081	NC_015942	AGA	2	6	53128	53133	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	344198284
1082	NC_015942	GTT	2	6	53275	53280	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	344198284
1083	NC_015942	GAA	2	6	53917	53922	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	344198285
1084	NC_015942	CTT	2	6	53932	53937	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	344198285
1085	NC_015942	TCC	2	6	53966	53971	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	344198285
1086	NC_015942	TTC	2	6	53983	53988	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	344198285
1087	NC_015942	GGAG	2	8	53993	54000	25 %	0 %	75 %	0 %	344198285
1088	NC_015942	CCTTTC	2	12	54067	54078	0 %	50 %	0 %	50 %	344198286
1089	NC_015942	GCC	2	6	54143	54148	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344198286
1090	NC_015942	TGAG	2	8	54192	54199	25 %	25 %	50 %	0 %	344198286
1091	NC_015942	CGG	2	6	54216	54221	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344198286
1092	NC_015942	TTC	2	6	54315	54320	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	344198286
1093	NC_015942	GAGT	2	8	55269	55276	25 %	25 %	50 %	0 %	344198287
1094	NC_015942	AGG	2	6	55356	55361	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	344198287
1095	NC_015942	TCA	2	6	55442	55447	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	344198287
1096	NC_015942	CTT	2	6	55460	55465	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	344198287
1097	NC_015942	AAT	2	6	55500	55505	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	344198287
1098	NC_015942	TTC	2	6	55549	55554	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	344198287
1099	NC_015942	A	6	6	55586	55591	100 %	0 %	0 %	0 %	344198287
1100	NC_015942	GCC	2	6	55617	55622	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344198287
1101	NC_015942	T	6	6	55631	55636	0 %	100 %	0 %	0 %	344198287
1102	NC_015942	TGA	2	6	56184	56189	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	344198288
1103	NC_015942	GGC	2	6	56191	56196	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344198288
1104	NC_015942	CAG	2	6	56223	56228	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344198288
1105	NC_015942	TGT	2	6	56244	56249	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	344198288
1106	NC_015942	CTGGAA	2	12	56267	56278	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	344198288
1107	NC_015942	GAC	2	6	56365	56370	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344198288
1108	NC_015942	GGCA	2	8	56383	56390	25 %	0 %	50 %	25 %	344198288
1109	NC_015942	GAC	2	6	56734	56739	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344198289
1110	NC_015942	TTC	2	6	56815	56820	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	344198289
1111	NC_015942	ATA	2	6	56861	56866	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	344198289
1112	NC_015942	CTC	2	6	56932	56937	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	344198289
1113	NC_015942	GGC	2	6	57014	57019	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344198289
1114	NC_015942	AGG	2	6	57021	57026	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	344198289
1115	NC_015942	CGA	2	6	57072	57077	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344198289
1116	NC_015942	CTG	2	6	57112	57117	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344198289
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1118	NC_015942	CA	3	6	57563	57568	50 %	0 %	0 %	50 %	344198290
1119	NC_015942	ATC	2	6	57698	57703	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	344198290
1120	NC_015942	GCC	2	6	57743	57748	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344198290
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1122	NC_015942	TCC	2	6	57782	57787	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	344198290
1123	NC_015942	CAC	2	6	57943	57948	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	344198290
1124	NC_015942	GCC	2	6	57977	57982	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344198290
1125	NC_015942	AGC	3	9	57983	57991	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344198290
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1129	NC_015942	CTG	2	6	58186	58191	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344198290
1130	NC_015942	GGTG	2	8	58207	58214	0 %	25 %	75 %	0 %	344198290
1131	NC_015942	GC	3	6	58307	58312	0 %	0 %	50 %	50 %	344198290
1132	NC_015942	GCGG	2	8	58316	58323	0 %	0 %	75 %	25 %	344198290
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1235	NC_015942	GCC	2	6	62418	62423	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344198292
1236	NC_015942	GC	3	6	62432	62437	0 %	0 %	50 %	50 %	344198292
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1242	NC_015942	CGG	3	9	62572	62580	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344198292
1243	NC_015942	GGC	2	6	62591	62596	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344198292
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1245	NC_015942	GCCGC	2	10	62616	62625	0 %	0 %	40 %	60 %	344198292
1246	NC_015942	CG	3	6	62633	62638	0 %	0 %	50 %	50 %	344198292
1247	NC_015942	CCG	3	9	62644	62652	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344198292
1248	NC_015942	CCG	2	6	62692	62697	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344198292
1249	NC_015942	GGC	2	6	62708	62713	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344198292
1250	NC_015942	AGC	2	6	62775	62780	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344198292
1251	NC_015942	CCG	2	6	62817	62822	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344198292
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1253	NC_015942	GACT	2	8	62851	62858	25 %	25 %	25 %	25 %	344198292
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1282	NC_015942	CTG	2	6	64252	64257	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344198294
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1369	NC_015942	A	6	6	68615	68620	100 %	0 %	0 %	0 %	344198299
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1371	NC_015942	GCGG	2	8	68710	68717	0 %	0 %	75 %	25 %	344198299
1372	NC_015942	T	6	6	68738	68743	0 %	100 %	0 %	0 %	344198299
1373	NC_015942	TGG	2	6	69292	69297	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	344198300
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1500	NC_015942	GCCA	2	8	76513	76520	25 %	0 %	25 %	50 %	344198306

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